Wiele osób spoza wspólnoty uważa ich za protestantów, ale niektórzy baptyści nie. Ich zdaniem baptyści istnieli oddzielnie od wczesnych dni kościoła. Osoby wyznające ten pogląd wierzą, że baptyści nigdy nie byli częścią Kościoła rzymskokatolickiego i że baptyści nie "protestują" przeciwko katolicyzmowi.
Podkreślają również, że baptyści nie mają żadnych związków z reformatorami takimi jak Luter, Kalwin czy Zwingli. Inni baptyści akceptują etykietę protestantów jako kategorię dla kościołów, które mają podobne poglądy religijne sola scriptura, sola fide, kapłaństwo wszystkich wierzących i inne stanowiska, które Luter lub Kalwin mieli w przeciwieństwie do Kościoła rzymskokatolickiego w latach 1500.
Etykieta: denominacja, jest odrzucana przez niektórych z powodu autonomicznego systemu używanego przez kościoły baptystyczne do kontroli. Bycie denominacją jest przez nich postrzegane jako posiadanie hierarchii, a nie jak w przypadku Kościoła rzymskokatolickiego. Innym powodem odrzucenia tego tagu jest wpływ okresu Odnowy na kościoły baptystyczne, który zburzył bariery denominacyjne. Inni baptyści akceptują metrykę. Uważają, że nie jest on kłamliwy ani nie ma żadnych złych znaczeń. Jest on po prostu używany jako synonim dla chrześcijańskiej lub religijnej grupy o wspólnych przekonaniach.
Znacznik: Evangelical, jest odrzucany przez niektórych fundamentalistycznych baptystów, którzy uważają, że termin ten nie jest wystarczająco "fundamentalistyczny". Jest on również odrzucany przez niektórych liberalnych baptystów, którzy uważają, że termin ten jest zbyt konserwatywny. Jest akceptowany przez umiarkowanych baptystów wierzących w przebudzenie w Stanach Zjednoczonych w latach 1700-tych, zwane Pierwszym Wielkim Przebudzeniem. Niektórzy ewangelicy również odrzucają tag: fundamentalista, ponieważ uważają, że jest on zbyt ekstremalny.
