Genom
Genom organizmu to cała jego dziedziczna informacja zakodowana w jego DNA (lub, dla niektórych wirusów, RNA). Obejmuje to zarówno geny, jak i niekodujące sekwencje DNA. Profesor Hans Winkler ukuł ten termin w 1920 roku.
Definicja Winklera, w tłumaczeniu, działa:
"Proponuję określenie genomu dla zestawu chromosomów haploidalnych, które wraz z odpowiednią protoplazmą określa podstawy materiałowe gatunku"....p165
Jednak żaden pojedynczy zestaw chromosomów haploidalnych nie określa nawet DNA danego gatunku. Ze względu na ogromną różnorodność alleli przenoszonych przez daną populację, każdy osobnik jest inny genetycznie. Nawet osobnik diploidalny niesie ze sobą odmianę genetyczną. Z tego powodu Dobzhansky preferował "zestaw chromosomów", a definicja musi być teraz szersza niż definicja Winklera. Genom zestawu chromosomów haploidalnych jest jedynie próbką całkowitej odmiany genetycznej danego gatunku.
Termin "genom" może być stosowany w szczególności w odniesieniu do kompletnego zestawu DNA jądrowego ("genom jądrowy"), ale może być również stosowany w odniesieniu do organeli, które zawierają własne DNA, jak w przypadku genomu mitochondrialnego lub genomu chloroplastowego.
Rozmiary genomu
| Organizm | Rozmiar genomu (pary podstawowe) | Uwaga |
| Wirus, Bakteriofag MS2 | 3569 | Pierwszy sekwencjonowany genomu RNA |
| Wirus, SV40 | 5224 | |
| Wirus, Phage Φ-X174 | 5386 | Pierwszy sekwencjonowany genom DNA |
| Wirus, Phage λ | 5×104 | |
| 1.6×105 | Najmniejszy genom niewirusowy, luty 2007 r. | |
| Bacterium, Escherichia coli | 4×106 | Najlepiej przebadana bakteria. |
| Bakteria, Solibactoer usitatus | 1×107 | Największy znany genom bakteryjny |
| Protista, Ameba dubia | 6.7×1011 | Największy znany genom, ale sporny. |
| Roślina, Arabidopsis thaliana | 1.57×108 | Pierwszy genom roślinny sekwencjonowany, grudzień 2000. |
| Roślina, Genlisea margaretae | 6.34×107 | Najmniejszy zarejestrowany genom rośliny kwitnącej, 2006. |
| Roślina, Fritillaria assyrica | 1.3×1011 | |
| Roślina, Populus trichocarpa | 4.8×108 | Pierwszy genom drzewa, wrzesień 2006 |
| Drożdże, Saccharomyces cerevisiae | 2×107 | |
| Grzybek, Aspergillus nidulans | 3×107 | |
| Nicień, Caenorhabditis elegans | 9.8×107 | Pierwszy wielokomórkowy genom zwierzęcy, grudzień 1998. |
| Insect, Drosophila melanogaster aka owocowa mucha | 1.3×108 | |
| Insect, Bombyx mori aka jedwabna ćma | 5.30×108 | |
| Insect, Apis mellifera aka honey bee | 1.77×109 | |
| Ryby, Tetraodon nigroviridis, rodzaj ryby puffer | 3.85×108 | Najmniejszy znany genom kręgowców |
| 3×109 | ||
| Ryba, Protopterus aethiopicus aka marmurkowata ryba płucna | 1.3×1011 | Największy znany genom kręgowców |
Uwaga: DNA z pojedynczej ludzkiej komórki ma długość ~1,8 m (ale przy szerokości ~2,4 nanometra).
Powiązane strony
- Gene
- Analiza sekwencji
- Ludzki genom
- ENCODE: pełna analiza ludzkiego genomu
Pytania i odpowiedzi
P: Co to jest genom?
O: Genom to całość informacji dziedzicznej organizmu zakodowanej w jego DNA (lub, w przypadku niektórych wirusów, RNA). Obejmuje ona zarówno geny, jak i niekodujące sekwencje DNA.
P: Kto wymyślił termin "genom"?
O: Profesor Hans Winkler ukuł termin "genom" w 1920 roku.
P: Co Winkler zdefiniował jako genom?
O: Winkler zdefiniował genom jako "haploidalny zestaw chromosomów, który wraz z właściwą protoplazmą określa materialne podstawy gatunku".
P: Czy każdy osobnik posiada różnorodność genetyczną?
O: Tak, dzięki allelom przenoszonym przez populację, każdy osobnik jest genetycznie zróżnicowany. Nawet osobniki diploidalne posiadają różnorodność genetyczną.
P: Co to znaczy, gdy mówimy "genom jądrowy"?
O: Kiedy mówimy "genom jądrowy", oznacza to w szczególności kompletny zestaw jądrowego DNA.
P: Czy oprócz genomu jądrowego istnieją inne genomy?
O: Tak, istnieją również genomy mitochondrialne i genomy chloroplastów, które zawierają własne DNA.
