Carsonella ruddii
Candidatus Carsonella ruddii jest endosymbiotyczną gamma proteobakterią. Ma najmniejszy znany genom spośród wszystkich bakterii.
Gatunek ten jest endosymbiontem występującym u wszystkich gatunków owadów żywiących się sokami floemowymi, znanych jako psyllidy. Endosymbionty występują w wyspecjalizowanej strukturze zwanej bakteriomem.
W 2006 roku genom jednego szczepu Ca. C. ruddi został zsekwencjonowany w RIKEN w Japonii i na Uniwersytecie Arizony. Genom jest kolistym chromosomem o długości 159 662 par zasad i charakteryzuje się wysoką gęstością kodowania (97%) z wieloma nakładającymi się genami i zredukowaną długością genów. Liczba przewidywanych genów wynosi 182, również najniższa w historii (NCBI-Genome). Brakuje wielu genów uważanych za niezbędne do życia, co sugeruje, że gatunek ten mógł osiągnąć status organelle-like.
Dla porównania, Mycoplasma genitalium, która ma najmniejszy genom spośród wszystkich organizmów żyjących na wolności, ma genom składający się z 521 genów.
Pytania i odpowiedzi
P: Co to jest Candidatus Carsonella ruddii?
O: Candidatus Carsonella ruddii jest endosymbiotyczną gamma proteobakterią, która występuje u wszystkich gatunków owadów żywiących się sokami łyka, zwanych psylidami.
P: Jaki jest rozmiar genomu Candidatus Carsonella ruddii?
O: Genom Candidatus Carsonella ruddii jest najmniejszym znanym genomem jakiejkolwiek bakterii i jest to okrągły chromosom o długości 159 662 par zasad.
P: Ile genów przewiduje się w Candidatus Carsonella ruddii?
O: Liczba przewidywanych genów w Candidatus Carsonella ruddii wynosi 182, co jest najniższą wartością w historii (NCBI-Genome).
P: Jaka jest gęstość kodowania genomu Candidatus Carsonella ruddii?
O: Genom Candidatus Carsonella ruddii ma wysoką gęstość kodowania wynoszącą 97%.
P: Co to jest bakteriome?
A: Bakteriom to wyspecjalizowana struktura, w której występują endosymbionty u Candidatus Carsonella ruddii.
P: Czego brakuje w genomie Candidatus Carsonella ruddii?
O: Wydaje się, że w genomie Candidatus Carsonella ruddii brakuje wielu genów uważanych za niezbędne do życia, co sugeruje, że gatunek ten mógł osiągnąć status organelli.
P: Jak wygląda genom Candidatus Carsonella ruddii w porównaniu z genomem Mycoplasma genitalium?
O: Genom Mycoplasma genitalium, która ma najmniejszy genom spośród wszystkich organizmów żyjących na wolności, ma 521 genów, co znacznie przewyższa liczbę przewidywanych genów u Candidatus Carsonella ruddii.
