Mycoplasma genitalium jest małą bakterią pasożytniczą, która żyje na komórkach nabłonka rzęskowego dróg płciowych i oddechowych naczelnych.
Ma jeden z najmniejszych znanych genomów i jest jedną z najmniejszych bakterii. Inne bardzo małe bakterie to endosymbiont Candidatus Carsonella ruddii i niedawno odkryta bakteria Nanoarchaeum. Najmniejszą znaną wolno żyjącą bakterią jest Pelagibacter ubique z 1,3 Mb.
Mycoplasma genitalium została pierwotnie wyizolowana w 1980 roku z cewki moczowej dwóch mężczyzn z niegonokokowym zapaleniem cewki moczowej. Zakażenie M. genitalium jest dość powszechne i jest przenoszone między partnerami podczas niezabezpieczonych stosunków płciowych. Może być leczone antybiotykami. Wiele pozostaje jeszcze do odkrycia na temat jego roli w chorobach seksualnych.
M. genitalium posiada 525 genów. W kolistym chromosomie o długości 582,970 par zasad znajdują się 482 geny kodujące białka. Wstępne badania genomu M. genitalium przy użyciu sekwencjonowania typu shotgun zostały przeprowadzone przez Petersona w 1993 roku. Następnie został on zsekwencjonowany przez Frasera i innych. Okazało się, że zawiera on tylko 470 przewidywanych regionów kodujących, w tym geny wymagane do replikacji DNA, transkrypcji i translacji, naprawy DNA, transportu komórkowego i metabolizmu energetycznego. Był to drugi po Haemophilus influenzae kompletny genom bakteryjny, jaki kiedykolwiek zsekwencjonowano.