Poniżej znajduje się oś czasowa sezonu huraganów na Atlantyku w 2006 r., w której wymieniono wszystkie formacje burzowe, wzmocnienia, osłabienia, wyjścia na ląd, przejścia pozatropowe, jak również rozproszenie. Sezon huraganów atlantyckich 2006 był sezonem, w którym zdarzenie El Niño zatrzymało wiele aktywności cyklonów tropikalnych, szczególnie w późniejszym okresie sezonu. Sezon oficjalnie rozpoczął się 1 czerwca 2006 i trwał do 30 listopada. Dla wygody i przejrzystości, na poniższej linii czasowej wszystkie miejsca wyjścia na ląd są pogrubione. Na osi czasu znajdują się również informacje, które nie zostały opublikowane operacyjnie, co oznacza, że uwzględniono informacje z przeglądów powybuchowych przeprowadzonych przez National Hurricane Center, takie jak informacje o nawałnicy, która nie została ostrzeżona operacyjnie.

Powyższy pasek graficzny daje krótki przegląd aktywności burzy w sezonie, a dla wygody, maksymalne natężenie burzy jest zawarte w postaci kolorowego paska. Burza Tropikalna Zeta z 2005 r. utrzymywała się do 2006 r., dlatego też w osi czasu w tekście zawarto część styczniową.