Keratyny są głównym składnikiem struktur, które wyrastają ze skóry:
- α-keratyn we włosach (włącznie z wełną), rogach, paznokciach, pazurach i kopytach ssaków
- twardsze β-keratyny w łuskach i pazurach gadów, ich skorupach (chelonia, np. żółw, żółw, żółw lądowy) oraz w piórach, dziobach i szponach ptaków. Keratyny te są uformowane głównie w arkusze beta. Jednakże arkusze beta występują również w α-keratynach.
Stawonogi, takie jak skorupiaki, często mają części swojego egzoszkieletu zbudowane z keratyny, czasem w połączeniu z chityną.
Keratyny znajdują się również w przewodzie pokarmowym wielu zwierząt, w tym glisty (która również ma zewnętrzną warstwę zbudowaną z keratyny).
Choć obecnie trudno to stwierdzić z całą pewnością, łuski, pazury, niektóre pancerze ochronne i dzioby dinozaurów prawie na pewno składały się z jakiegoś rodzaju keratyny.