Armia Missisipi (zwana również Konfederacką Armią Missisipi) była armią konfederacką podczas amerykańskiej wojny secesyjnej. Nie należy jej mylić z Armią Unii Missisipi. Została sformowana 29 marca 1862 roku. Dowódcą był generał broni Albert Sidney Johnston, a drugim dowódcą generał broni P.G.T. Beauregard. Po śmierci Johnstona w bitwie pod Shiloh, dowództwo objął Beauregard. Potem nastąpiła seria dowódców. W listopadzie 1862 r. Armia Missisipi została przemianowana na Armię Tennessee. Druga armia o nazwie Armia Missisipi została utworzona w grudniu 1862 roku, pod dowództwem generała porucznika Johna C. Pembertona. Armia ta miała zagmatwaną liczbę dodatkowych nazw. II korpus, pod dowództwem generała majora Sterlinga Price'a nazywany był "Armią Zachodniego Tennessee". Nazywano ją również Armią Zachodu. Kiedy oba korpusy (I korpus i II korpus) zostały przekształcone w dywizje w styczniu 1863 r., porzuciły nazwę Armia Missisipi. Leonidas Polk dowodził I korpusem. W maju 1864 r. oddziały Polka połączyły się z Armią Tennessee Josepha E. Johnstona, tworząc trzecią Armię Missisipi. Polk zginął w czerwcu 1862 roku, po czym armię nazwano po prostu korpusem Alexandra P. Stewarta.