W chemii i fizyce, teoria atomu wyjaśnia, jak nasze rozumienie atomu zmieniało się w czasie. Kiedyś sądzono, że atomy to najmniejsze cząstki materii. Obecnie wiadomo jednak, że atomy składają się z protonów, neutronów i elektronów. Te subatomowe cząstki zbudowane są z kwarków. Pierwszy pomysł na atom pochodził od greckiego filozofa Demokryta. Wiele pomysłów w nowoczesnej teorii pochodzi od Johna Daltona, brytyjskiego chemika i fizyka.

Teoria ta ma zastosowanie do ciał stałych, cieczy i gazów, ale nie ma zastosowania w sposób analogiczny do plazmy czy gwiazd neutronowych.