Rwanda, o powierzchni 26 338 km2 (10 169 m²), jest 149. co do wielkości krajem na świecie. Cały kraj znajduje się na dużej wysokości. Najniżej położonym punktem jest rzeka Rusizi na wysokości 950 metrów (3 117 stóp) nad poziomem morza. Rwanda znajduje się w środkowo-wschodniej Afryce. Od zachodu graniczy z Demokratyczną Republiką Konga, od północy z Ugandą, od wschodu z Tanzanią, a od południa z Burundi. Znajduje się kilka stopni na południe od równika i jest krajem bez dostępu do morza. Stolica kraju, Kigali, znajduje się w pobliżu centrum Rwandy.
Najdłuższą rzeką kraju jest Nyabarongo. Rzeka Nyabarongo-Kagera wpada ostatecznie do Jeziora Wiktorii. Rwanda ma wiele jezior, z których największym jest Jezioro Kivu. Jest to jedno z dwudziestu najgłębszych jezior na świecie. Inne duże jeziora to Burera, Ruhondo, Muhazi, Rweru i Ihema. Ihema jest największym z szeregu jezior na wschodnich równinach Parku Narodowego Akagera.
W środkowej i zachodniej Rwandzie znajduje się wiele gór. Najwyższe szczyty znajdują się w łańcuchu wulkanów Virunga w północno-zachodniej części kraju. Należy do nich góra Karisimbi, najwyższy punkt Rwandy, o wysokości 4.507 metrów (14.787 stóp). Centrum kraju to głównie faliste wzgórza. Na wschodniej granicy znajduje się sawanna, równiny i bagna.
W Rwandzie panuje klimat umiarkowany zwrotnikowy wyżynny. Ma niższe temperatury niż typowe dla krajów równikowych. Wynika to z dużej wysokości nad poziomem morza. Kigali, w centrum kraju, ma typowy dzienny zakres temperatur pomiędzy 12 ° C (54 ° F) i 27 ° C (81 ° F). Zmiany w ciągu roku są niewielkie. W ciągu roku występują dwie pory deszczowe. Pierwsza z nich trwa od lutego do czerwca, a druga od września do grudnia. Oddzielone są one dwiema porami suchymi. Główna z nich trwa od czerwca do września, podczas której często nie ma żadnych opadów. Krótsza i mniej dotkliwa trwa od grudnia do lutego.