Dolina, w której znajduje się prowincja, została nazwana przez hiszpańskich konkwistadorów Sabana de Bonao ("Bonao Savanna"; Bonao było nazwą Taíno dla tego regionu.
Bartholomew Columbus, młodszy brat Krzysztofa Kolumba, założył tu fort w latach 1495-1497, a Bonao stało się jednym z najważniejszych miast wyspy Hispaniola w pierwszych latach istnienia hiszpańskiej kolonii.
Później, miasto zostało opuszczone i założone ponownie podczas okupacji haitańskiej pod nazwą "Paraje del Yuna". W 1859 roku, stało się posterunkiem wojskowym w gminie La Vega. W 1936 roku, stało się gminą prowincji La Vega pod nazwą Monseñor Nouel.
Prowincja została utworzona w 1982 r. z gminy Monseñor Nouel i okręgów miejskich Piedra Blanca i Maimón. W 2005 roku nazwa gminy Monseñor Nouel została zmieniona na Bonao, mimo że nazwa ta była zmieniana od 1960 roku.
W 1982 r. Maimón stał się gminą, a w 1991 r. Piedra Blanca stała się trzecią gminą prowincji. Villa Sonador stała się okręgiem miejskim w 1999 roku, Sabana del Puerto w 2000 roku, Juan Adrián w 2001 roku, Juma Bejucal w 2004 roku, a Arroyo Toro-Masipedro i Jayaco w 2006 roku.