Dzisiejszy Sudan Południowy był kiedyś częścią Sudanu Anglo-Egipskiego. Ta część Imperium Brytyjskiego stała się Republiką Sudanu po uzyskaniu niepodległości w 1956 roku. Po pierwszej sudańskiej wojnie domowej, w 1972 roku powstał Region Autonomiczny Sudanu Południowego, który przetrwał do 1983 roku. Wkrótce wybuchła druga sudańska wojna domowa, która zakończyła się kompleksowym porozumieniem pokojowym z 2005 roku. W tym samym roku utworzono Autonomiczny Rząd Sudanu Południowego. Sudan Południowy stał się niepodległym państwem 9 lipca 2011 roku o północy czasu lokalnego, po referendum przeprowadzonym w styczniu 2011 roku. W referendum prawie 99% głosujących opowiedziało się za oddzieleniem od reszty Sudanu.
Rada Bezpieczeństwa Organizacji Narodów Zjednoczonych zebrała się 13 lipca 2011 r., aby formalnie przedyskutować kwestię członkostwa Republiki Sudanu Południowego w Organizacji Narodów Zjednoczonych. Następnego dnia, 14 lipca 2011 r., Sudan Południowy stał się państwem członkowskim Organizacji Narodów Zjednoczonych. Sudan Południowy złożył również wniosek o członkostwo we Wspólnocie Narodów, Wspólnocie Wschodnioafrykańskiej, Międzyrządowym Urzędzie ds. Rozwoju, Międzynarodowym Funduszu Walutowym i Banku Światowym. Rozwoju, Międzynarodowego Funduszu Walutowego oraz Banku Światowego. Kraj ten został również uznany za uprawniony do ubiegania się o członkostwo w Lidze Arabskiej.
Na Letnich Igrzyskach Olimpijskich w 2012 r. jeden sportowiec z Sudanu Południowego startował pod flagą Międzynarodowego Komitetu Olimpijskiego. W 2013 roku wybuchła wojna domowa.