Organizmy jednokomórkowe to organizmy, które posiadają jedną komórkę. Dzieli się je na dwa całkiem różne typy, z różnych królestw klasyfikacyjnych.
Różnice między prokariotami a eukariotami są znaczące. Eukarionty posiadają jądro i różne organy subkomórkowe zwane organellami, a prokarionty nie.
Prawie wszystkie organizmy jednokomórkowe są mikroorganizmami, ale można obserwować eukariota i wiele prokariota za pomocą mikroskopu złożonego. Bakterie pojawiają się po prostu jako ciemne kropki. Aby zebrać organizmy jednokomórkowe do obserwacji, można położyć na powierzchni wody w stawie nakrywkę i pozostawić ją na noc. Następnego ranka liczne organizmy jednokomórkowe wyrosną w postaci kolonii na dnie szkiełka. Rozmnażają się one szybko: kolonie mogą podwoić swoją wielkość w czasie od 30 minut do kilku godzin.
Organizmy jednokomórkowe można znaleźć wszędzie. Najstarsze formy życia istniały 3,8 miliarda lat temu, jeśli nie dłużej. Stosują one różne strategie przetrwania: fotosyntezę (sinice), chemotrofię (wiele archaidów) i heterotrofię (ameby). Niektóre organizmy jednokomórkowe mają chorągiewki, małe ogonki, których używają do poruszania się, lub lobopody, przedłużenia szkieletu komórkowego (cytoszkieletu), które wyglądają jak ramiona przypominające plamki. Flagi naszych jednokomórkowych przodków występują aż do zwierząt, gdzie pojawiają się jako flagellowane plemniki.
Spośród wszystkich sześciu supergromad eukariotów cztery składają się wyłącznie z organizmów jednokomórkowych. Organizmy jednokomórkowe różnią się wielkością, najmniejsze bakterie mierzą zaledwie jedną trzecią mikrona (300 nanometrów) średnicy, a ich rozmiary sięgają aż do tytanicznych plazmodialnych pleśni śluzowych, które mogą osiągać 20 cm średnicy. Największe organizmy jednokomórkowe mogą mieć miliony jąder rozrzuconych po całej otoczce komórkowej. Do obserwacji najmniejszych organizmów jednokomórkowych potrzebny jest mikroskop elektronowy, natomiast największe z nich można zobaczyć za pomocą mikroskopu lub czegoś, co poprawia jakość obrazu.