Pierwsza część metra, która zastąpiła bardzo ruchliwą trasę tramwajową, podążała ulicą Yonge od Eglinton Avenue na południe do Front Street, następnie skręciła na zachód na jedną przecznicę, by zakończyć się przy Bay Street, obok głównego dworca kolejowego miasta, a więc stacja metra nazywała się również Union. Linia ta została ukończona w 1954 roku i miała 7,4 km długości.
W 1963 r. dodano kolejną część, która pojechała na północ od stacji Union, poniżej University Avenue i Queen's Park, w pobliże Bloor Street, gdzie skręciła na zachód, by zakończyć się przy St George i Bloor Street.
Linia Bloor-Danforth została otwarta w 1966 r. wzdłuż Bloor Street i Danforth Avenue od Keele Street do Woodbine Avenue, a w 1968 r. została przedłużona, aby przebiegać od Islington Avenue do stacji Warden przy Warden i St. Clair Avenue.
Przeprowadzenie linii przez Dolinę Don było możliwe dzięki wyborowi dokonanemu ponad czterdzieści lat wcześniej. Kiedy w 1919 r. zbudowano wiadukt księcia Edwarda przez rzekę Don, jego konstrukcja obejmowała bliźniacze pokłady pod drogą, aby umożliwić przyszłe linie kolejowe. Umożliwiło to przejazd metrem przez Dolinę Don do Alei Danfortha od strony wschodniej.
Linia Yonge-University została przedłużona na północ o 8,7 km od Eglinton Avenue do Finch Avenue i Yonge w 1973 i 1974 roku.
Kolejna trasa (9,9 km) została dodana do linii Yonge-University w 1978 roku, kiedy to została przedłużona z St. George i Bloor, na północ i północny zachód do Eglinton Avenue i Allen Road, a następnie na północ wzdłuż środka Allen Road do Wilson Avenue.
W październiku 1976 r. podpalenie (pożar podpalony celowo) zniszczyło wagony metra i uszkodziło stację Christie. Spowodowało to zamknięcie linii Bloor-Danforth na trzy dni, a stację Christie na jakiś czas zamknięto do naprawy. Kolejny tor został dodany w 1980 roku na obu końcach linii Bloor-Danforth. Każdy z tych rozszerzeń dodał jedną stację, zatoki autobusowe oraz, na wschodnim końcu, miejsce na podłączenie do Scarborough RT.
Dzięki sześciu stacjom na 6,8 km torów, Scarborough RT jest linią zbudowaną prawie w całości nad ziemią, która nie posiada bezpośrednich torów łączących się z innymi liniami i wykorzystuje inne pociągi. Wykorzystuje ona pociągi systemu ICTS (Intermediate Capacity Transit System), który bardzo różni się od pociągów metra. Trasa jest całkowicie oddzielona od ruchu drogowego i pieszego, stacje są w pełni zadaszone, a pociągi mają wiele drzwi, które wykorzystują wysokie perony.
Dodano dodatkowe 1,6 km na północnym krańcu Spadiny linii Jonge-University-Spadina, dodając jedną stację (Downsview), z parkingiem dla autobusów.
W sierpniu 1995 r. TTC miała naprawdę zły wypadek w metrze, jak to się nazywa, w wypadku na Russell Hill, na linii Yonge-University-Spadina na południe od stacji St. Clair West. Trzy kobiety zginęły, a 100 osób zostało rannych, kilka poważnie.
Najnowsza linia metra, Sheppard, została otwarta w 2002 roku. Biegnie ona 5,5 km na wschód, pod Sheppard Avenue, od stacji Sheppard na linii Yonge (obecnie zwanej Sheppard-Yonge), do stacji Don Mills na Sheppard i Don Mills Road. Linia Sheppard ma mniej użytkowników niż dwie pozostałe linie metra i kursują na niej krótsze pociągi.
W swojej ponad pięćdziesięcioletniej historii pierwsze dziecko, które urodziło się na peronie stacji metra TTC, pojawiło się dopiero niedawno, 6 lutego 2006 roku. Zdarzenie to miało miejsce na stacji Wellesley i spowodowało opóźnienia w systemie metra. Przez wiele dni była to wiadomość na pierwszej stronie gazety.
Dodano automatyczny system głosowy do ogłaszania każdej stacji (np.: "Następna stacja to Bloor, stacja Bloor."), co zakończyło potrzebę ogłaszania przez operatora pociągu każdego przystanku. System automatyczny jest wykorzystywany w całym metrze oraz w systemie RT.
