Scarborough był jednym z sześciu skazanych statków transportowych w Pierwszej Flocie. Pierwsza Flota przewoziła skazańców i żołnierzy do Australii, aby założyć kolonię karną. Statki opuściły Anglię w maju 1787 roku i dotarły do Australii w styczniu 1788 roku. Był to początek europejskiego osadnictwa w Australii. Trasa Floty obejmowała kilka etapów zaopatrzeniowych i postojów – m.in. Teneryfę, Rio de Janeiro i Przylądek Dobrej Nadziei – co było typowe dla długich podróży morskich tamtego okresu.
Scarborough był 430-tonowym statkiem pod dowództwem Johna Marshalla. Miał długość 34 m (111 stóp) i szerokość 9 m (30 stóp). Pokład więzienny był bardzo mały i ciasny. Wysokość pokładu wynosiła tylko 53 stopnie (135 cm). Warunki w ładowni były surowe: przeludnienie, słaba wentylacja i ograniczona przestrzeń do leżenia sprawiały, że podróż była dla skazańców trudna zarówno fizycznie, jak i psychicznie. Na każdym z okrętów Pierwszej Floty znajdował się oficjalny chirurg (surgeon), odpowiedzialny za opiekę medyczną; rządy wymagały od armatorów przestrzegania minimalnych standardów opieki i żywienia. Statek miał umowę z rządem brytyjskim na przewóz skazńców. Właściciele otrzymywali wynagrodzenie w wysokości 10 szylingów za tonę miesięcznie. Musieli oni zgodzić się na bezpieczne przetrzymywanie więźniów. Po przewiezieniu skazanych do Nowej Południowej Walii, Scarborough miał kontrakt na pracę dla East India Company, co było częstą praktyką umożliwiającą armatorom dodatkowy zarobek poprzez przewóz towarów handlowych (np. herbaty) z Azji do Anglii.
Scarborough opuścił Australię 5 maja 1788 roku, a wraz z Lady Penrhyn popłynął do Chin. Podróż w rejon Pacyfiku obejmowała postoje na uzupełnienie zapasów i zdobycze przyrodnicze: 17 maja 1788 r. wylądowała na wyspie Lord Howe dla ptaków i warzyw, co miało pomóc w uzupełnieniu świeżej żywności dla załóg. Następnie okręt skierował się ku Azji, aby wykonywać zadania na rzecz East India Company — typowo polegające na załadunku ładunków handlowych i transporcie do Europy. 15 czerwca 1789 r. Scarborough wrócił do Anglii, kończąc swój udział w pierwszym etapie brytyjskiej kolonizacji Australii.
Dziedzictwo statku Scarborough wiąże się z początkiem trwałej obecności brytyjskiej w Australii i z historią systemu karnego wykorzystującego transport jako narzędzie kolonizacji. Dokumenty przewozowe, dzienniki podróży i raporty chirurgów z Pierwszej Floty są dziś źródłami dla historyków badającymi warunki podróży, organizację transportów oraz życie skazańców i załóg podczas tej przełomowej ekspedycji.