Notts County rozpoczął działalność w 1862 roku. Klub został założony przed The Football Association i na początku grał w grę z zasadami klubowymi, a nie w piłkę nożną stowarzyszeniową. W momencie rozpoczęcia działalności Notts County, podobnie jak większość drużyn sportowych, był uważany za klub "tylko dla dżentelmenów". Notts County jest uważane za jeden z początków obecnej gry, przypisuje się im nawet wynalezienie pułapki offside[]. Notts County jest najstarszym z profesjonalnych klubów piłkarskich na świecie (istnieją starsze kluby zawodowe w innych dyscyplinach piłkarskich).
Początkowo klub grał w Park Hollow na zamku Nottingham. W grudniu 1864 roku podjęto decyzję o rozgrywaniu meczów z drużynami z zewnątrz i zdecydowano, że klub musi znaleźć większy obiekt. Po graniu w kilku miejscach, The Magpies osiedlili się na Trent Bridge Cricket Ground w 1883 roku.
Liga Piłki Nożnej
W 1888 roku Notts County, wraz z jedenastoma innymi klubami piłkarskimi, zostało członkiem-założycielem Football League. Swój pierwszy sezon ligowy zakończyli na jedenastym miejscu. W sezonie 1890-91 Notts County zajęło trzecie miejsce w lidze, a dziesięć sezonów później również trzecie miejsce.
Finały Pucharu Anglii
25 marca 1891 roku Notts County po raz pierwszy dotarło do finału FA Cup, ale nie wygrało.
Notts County zrekompensowało to sobie w 1894 roku, kiedy to po raz pierwszy w swojej historii zdobyło Puchar Anglii na Goodison Park. The Magpies pokonali Bolton Wanderers 4-1, a Jimmy Logan zaliczył pierwszego hat-tricka w historii finału FA Cup. Notts County stało się pierwszym klubem spoza pierwszej ligi, który wygrał FA Cup - w tamtym sezonie zajęli trzecie miejsce w Second Division.
