Chromosom X jest jednym z dwóch chromosomów płciowych u ssaków. Decydują one o płci osobnika. Drugim chromosomem płciowym jest chromosom Y.
Samice mają dwa chromosomy X, a samce jeden X i jeden Y. Jajo zawsze zawiera pojedynczy X, a plemniki albo X, albo Y. W ten sposób określana jest płeć u ludzi i u większości innych ssaków. Chociaż samice mają dwa chromosomy X, każda komórka może mieć aktywny tylko jeden chromosom X. Podczas wczesnego rozwoju zachodzi proces zwany inaktywacją chromosomu X. W każdej komórce jeden z chromosomów X losowo ulega dezaktywacji. Powoduje to, że różne części ciała mają różne geny sprzężone z chromosomem X i jest odpowiedzialne za czarne i pomarańczowe ubarwienie kotów calico.

