Obszar ten był częścią Rezerwatu Aborygenów Australii Centralnej, gdy rezerwat został utworzony w 1922 roku. W 1955 roku, jednak granice rezerwatu zostały przesunięte, aby umożliwić górnictwo i poszukiwanie, głównie niklu. Obozy górnicze zostały założone w okolicach dzisiejszego Irrunytju. W odpowiedzi na to, rodziny Aborygenów przeniosły się do osiedlenia się wokół tych obozów. Niektórzy pracowali z górnikami i otrzymywali wynagrodzenie w postaci racji żywnościowych; inni po prostu chronili miejsca o znaczeniu duchowym przed osobami postronnymi. Niektóre firmy podjęły kroki, aby upewnić się, że ich górnicy szanują te miejsca; inne nie, a kilka świętych miejsc zostało zniszczonych w tym okresie. Obszar ten został ponownie włączony do rezerwatu w 1972 roku.
Kiedy górnicy odeszli, rodziny aborygeńskie pozostały i zbudowały stałą osadę, wykorzystując to, co pozostało z obozów górniczych (schrony, otwory, itp.). Społeczność otrzymała również pieniądze od rządu federalnego, aby pomóc w założeniu stałej osady. Społeczność została zarejestrowana w 1976 roku. W 1981 roku stała się członkiem Rady Ngaanyatjarra.
Od 1972 roku Irrunytju pozostaje na ziemiach Aborygenów. Działalność gospodarcza na tym obszarze jest regulowana przez Ngaanyatjarra Indigenous Land Use Agreement, utworzony w 2006 roku. Społeczność utrzymuje wiele tradycyjnych zajęć, takich jak polowanie i zbieranie bush tucker. Od 2001 roku społeczność posiada własne centrum sztuki, Irrunytju Arts.