Szyfr substytucyjny jest formą kryptografii.

W szyfrze substytucyjnym, reguła jest używana do zmiany każdej litery wiadomości, po jednym na raz. Reguła mówi, aby zastąpić (lub "substytut") każdą literę inną literą z alfabetu.

Na przykład, ta tabela podaje regułę dla szyfru substytucyjnego:

Używając tej reguły, zdanie "Jack i Jill poszli na górę" zmieniamy na "Etar tzn Evmm gkzc dw cuk uvmm". Szyfr Cezara jest jednym z przykładów szyfru zastępczego.

Szyfry substytucyjne nie są wystarczająco bezpieczne, aby używać ich do przesyłania ważnych wiadomości. Szyfry substytucyjne mogą być złamane przez pomysł zwany analizą częstotliwości. Niektóre litery występują częściej niż inne w angielskich zdaniach: E jest najczęstsze, potem T, potem A, i tak dalej. Wiadomość, która została zmieniona przez szyfr substytucyjny będzie miał różne wspólne litery, ale to daje wskazówkę na temat zasady. Najczęściej występujące litery w zmienionej wiadomości będą najprawdopodobniej najczęściej występującymi literami w języku angielskim. Łamanie kryptogramów (wiadomości ukrytych za pomocą szyfru zastępczego) to popularna łamigłówka, którą często można znaleźć w gazetach.